Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C8orf48Q96LL4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C8orf48Q96LL4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf48Q96LL4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms