Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATXN7L3BQ96GX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN7L3BQ96GX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN7L3BQ96GX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms