Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BCANQ96GW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BCANQ96GW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
BCANQ96GW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BCANQ96GW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BCANQ96GW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BCANQ96GW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
BCANQ96GW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BCANQ96GW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BCANQ96GW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BCANQ96GW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.81■■■■□ 3
BCANQ96GW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BCANQ96GW7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BCANQ96GW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.8■■■■□ 3
BCANQ96GW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BCANQ96GW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.79■■■■□ 3
BCANQ96GW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BCANQ96GW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BCANQ96GW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BCANQ96GW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
BCANQ96GW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BCANQ96GW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
BCANQ96GW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BCANQ96GW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
BCANQ96GW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
BCANQ96GW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms