Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMIM12Q96EX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM12Q96EX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms