Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRRFQ96E11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRRFQ96E11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRRFQ96E11 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms