Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3KBP1Q96B97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3KBP1Q96B97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3KBP1Q96B97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms