Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOPBP1Q92547 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOPBP1Q92547 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOPBP1Q92547 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms