Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F8

ZNF454, Zinc finger protein 454, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF454Q8N9F8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF454Q8N9F8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF454Q8N9F8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms