Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSL3Q8N5Y2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSL3Q8N5Y2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSL3Q8N5Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms