Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE3Q8IX30 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE3Q8IX30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCUBE3Q8IX30 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms