Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRIP3Q6Q6R5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRIP3Q6Q6R5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms