Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMED8Q6PL24 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMED8Q6PL24 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMED8Q6PL24 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms