Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED27Q6P2C8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED27Q6P2C8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms