Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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LCN8Q6JVE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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LCN8Q6JVE9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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LCN8Q6JVE9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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LCN8Q6JVE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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LCN8Q6JVE9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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LCN8Q6JVE9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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LCN8Q6JVE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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LCN8Q6JVE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN8Q6JVE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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