Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39BQ5VTQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC39BQ5VTQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC39BQ5VTQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39BQ5VTQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms