Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF38BQ5VTL8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF38BQ5VTL8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF38BQ5VTL8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms