Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD3Q5T2D3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms