Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4BQ5SQS7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2D4BQ5SQS7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms