Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL39P5Q59GN2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms