Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODF4Q2M2E3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF4Q2M2E3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms