Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXT1Q16394 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXT1Q16394 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms