Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SQLEQ14534 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms