Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF9Q13886 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KLF9Q13886 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLF9Q13886 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KLF9Q13886 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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