Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTB1Q13884 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB1Q13884 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms