Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUL4AQ13619 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4AQ13619 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4AQ13619 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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