Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED1Q13445 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED1Q13445 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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