Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3FQ13275 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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