Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPB3Q12988 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPB3Q12988 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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