Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GRIN2AQ12879 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
GRIN2AQ12879 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
GRIN2AQ12879 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
GRIN2AQ12879 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
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