Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNA1Q09470 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNA1Q09470 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNA1Q09470 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms