Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPIRE1Q08AE8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIRE1Q08AE8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms