Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFAMQ00059 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.4 ms