Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MPP1Q00013 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MPP1Q00013 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.7 ms