Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2C1P98194 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2C1P98194 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2C1P98194 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms