Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM4P67936 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM4P67936 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM4P67936 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TPM4P67936 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM4P67936 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM4P67936 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM4P67936 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM4P67936 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM4P67936 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM4P67936 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM4P67936 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM4P67936 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM4P67936 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM4P67936 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPM4P67936 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPM4P67936 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPM4P67936 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPM4P67936 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPM4P67936 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPM4P67936 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPM4P67936 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM4P67936 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM4P67936 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM4P67936 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM4P67936 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPM4P67936 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPM4P67936 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM4P67936 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM4P67936 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM4P67936 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TPM4P67936 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM4P67936 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM4P67936 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM4P67936 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM4P67936 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPM4P67936 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPM4P67936 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms