Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2IP63279 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2IP63279 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms