Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOAP61586 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOAP61586 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOAP61586 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOAP61586 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOAP61586 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOAP61586 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOAP61586 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOAP61586 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOAP61586 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOAP61586 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOAP61586 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOAP61586 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOAP61586 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOAP61586 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOAP61586 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOAP61586 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOAP61586 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOAP61586 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOAP61586 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOAP61586 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOAP61586 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOAP61586 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOAP61586 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOAP61586 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOAP61586 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOAP61586 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOAP61586 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOAP61586 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOAP61586 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOAP61586 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOAP61586 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOAP61586 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOAP61586 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOAP61586 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOAP61586 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOAP61586 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOAP61586 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOAP61586 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOAP61586 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOAP61586 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms