Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSME3P61289 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSME3P61289 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME3P61289 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME3P61289 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME3P61289 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME3P61289 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME3P61289 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME3P61289 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME3P61289 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME3P61289 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME3P61289 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME3P61289 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME3P61289 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME3P61289 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSME3P61289 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSME3P61289 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSME3P61289 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME3P61289 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME3P61289 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME3P61289 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms