Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms