Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RTP1P59025 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP1P59025 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP1P59025 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RTP1P59025 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP1P59025 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP1P59025 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RTP1P59025 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP1P59025 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP1P59025 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP1P59025 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP1P59025 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RTP1P59025 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RTP1P59025 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RTP1P59025 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP1P59025 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP1P59025 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP1P59025 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP1P59025 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RTP1P59025 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RTP1P59025 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP1P59025 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP1P59025 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP1P59025 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RTP1P59025 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP1P59025 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP1P59025 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP1P59025 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RTP1P59025 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTP1P59025 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP1P59025 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP1P59025 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP1P59025 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RTP1P59025 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RTP1P59025 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTP1P59025 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTP1P59025 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP1P59025 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms