Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH6P55285 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH6P55285 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH6P55285 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH6P55285 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH6P55285 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH6P55285 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH6P55285 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH6P55285 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH6P55285 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH6P55285 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH6P55285 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH6P55285 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH6P55285 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH6P55285 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH6P55285 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH6P55285 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH6P55285 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH6P55285 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH6P55285 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH6P55285 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH6P55285 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH6P55285 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH6P55285 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH6P55285 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH6P55285 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH6P55285 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH6P55285 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms