Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3M2P53677 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP3M2P53677 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms