Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRCA2P51587 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRCA2P51587 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms