Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NESP48681 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NESP48681 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NESP48681 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NESP48681 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NESP48681 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NESP48681 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NESP48681 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NESP48681 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NESP48681 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NESP48681 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NESP48681 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
NESP48681 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NESP48681 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
NESP48681 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NESP48681 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NESP48681 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
NESP48681 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NESP48681 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NESP48681 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
NESP48681 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NESP48681 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NESP48681 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NESP48681 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
NESP48681 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
NESP48681 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NESP48681 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NESP48681 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NESP48681 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NESP48681 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NESP48681 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NESP48681 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NESP48681 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
NESP48681 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NESP48681 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NESP48681 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NESP48681 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NESP48681 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NESP48681 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
NESP48681 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NESP48681 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NESP48681 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NESP48681 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NESP48681 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NESP48681 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NESP48681 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NESP48681 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NESP48681 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NESP48681 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NESP48681 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NESP48681 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
NESP48681 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NESP48681 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NESP48681 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NESP48681 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NESP48681 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
NESP48681 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
NESP48681 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms