Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD8P48556 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms