Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT3P45378 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNT3P45378 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNT3P45378 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms