Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGAEP38570 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITGAEP38570 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITGAEP38570 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ITGAEP38570 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.5 ms