Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPAP23025 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
XPAP23025 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPAP23025 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPAP23025 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPAP23025 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPAP23025 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPAP23025 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPAP23025 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPAP23025 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPAP23025 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPAP23025 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPAP23025 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPAP23025 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPAP23025 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPAP23025 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPAP23025 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPAP23025 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPAP23025 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPAP23025 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPAP23025 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPAP23025 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPAP23025 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPAP23025 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPAP23025 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPAP23025 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPAP23025 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPAP23025 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPAP23025 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPAP23025 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPAP23025 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPAP23025 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPAP23025 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPAP23025 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPAP23025 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XPAP23025 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPAP23025 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPAP23025 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XPAP23025 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms