Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX1P22670 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX1P22670 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX1P22670 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX1P22670 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX1P22670 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX1P22670 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX1P22670 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX1P22670 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX1P22670 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX1P22670 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX1P22670 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX1P22670 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX1P22670 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX1P22670 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX1P22670 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX1P22670 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX1P22670 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFX1P22670 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFX1P22670 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFX1P22670 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFX1P22670 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX1P22670 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX1P22670 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX1P22670 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX1P22670 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX1P22670 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX1P22670 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX1P22670 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX1P22670 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX1P22670 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX1P22670 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms