Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACO1P21399 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACO1P21399 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACO1P21399 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACO1P21399 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACO1P21399 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACO1P21399 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACO1P21399 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACO1P21399 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACO1P21399 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACO1P21399 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACO1P21399 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACO1P21399 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACO1P21399 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACO1P21399 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACO1P21399 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACO1P21399 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACO1P21399 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACO1P21399 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACO1P21399 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACO1P21399 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACO1P21399 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACO1P21399 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACO1P21399 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACO1P21399 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACO1P21399 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACO1P21399 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACO1P21399 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACO1P21399 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACO1P21399 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACO1P21399 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACO1P21399 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACO1P21399 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACO1P21399 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACO1P21399 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms